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As sequências ricas em G formadoras de quádruplos são distribuídas de forma desigual por todo o genoma humano.Seu enriquecimento em promotores oncogênicos e telômeros gerou interesse no direcionamento do G-quadruplex (GQ) para uma terapia anticancerígena.Aqui, apresentamos uma análise quantitativa das conformações e dinâmica das sequências formadoras de GQ medidas por fluorescência de molécula única.Além disso, relacionamos essas propriedades aos ligantes de direcionamento de GQ e à ligação da proteína G4 resolvase 1 (G4R1).Nosso resultado mostra que tanto o comprimento do loop (componentes não-G) quanto a sequência contribuem para a conformação do GQ.Traços de moléculas únicas em tempo real revelam que a dinâmica de dobramento também depende da composição do loop.Demonstramos que pequenas moléculas estabilizadoras de GQ, N-metil mesoporfirina IX (NMM), seu análogo, NMP e a proteína G4R1 ligam-se seletivamente à conformação GQ paralela.Nossas descobertas apontam para a complexidade do dobramento de GQ governado pelo comprimento e sequência do loop e como a conformação de GQ determina a propensão de ligação de moléculas pequenas e proteínas.