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A topologia da membrana do domínio do canal E1 da colicina foi estudada por transferência de energia de ressonância de fluorescência (FRET).O FRET envolveu um aminoácido fluorescente geneticamente codificado (cumarina) como o doador e um resíduo de cisteína marcado seletivamente amarrado com DABMI (4-(dimetilamino)fenilazofenil-4'-maleimida) como o aceitador FRET.O resíduo de cumarina fluorescente foi incorporado à proteína por meio de um par ortogonal de tRNA/aminoacil-tRNA sintetase que permitiu a incorporação seletiva em qualquer local dentro do domínio do canal de colicina.Cada variante continha uma mutação stop (TAG) para incorporação de cumarina e uma mutação de cisteína (TGT) para ligação DABMI.Seis distâncias inter-helicoidais dentro das hélices 1-6 foram determinadas usando análise FRET para ambos os estados solúvel e ligado à membrana.Os dados FRET mostraram grandes mudanças nas distâncias inter-hélices entre as hélices 3-6 após a associação da membrana, fornecendo uma nova visão sobre a estrutura ligada à membrana do domínio do canal.Em geral, as eficiências inter-helicoidais da cumarina-DABMI FRET diminuíram após a ligação da membrana, com base no modelo guarda-chuva para o canal de colicina.Um modelo provisório para o estado fechado do domínio do canal foi desenvolvido com base nos dados FRET atuais e publicados anteriormente.O modelo sugere arranjo circular das hélices 1-7 no sentido horário a partir do lado extracelular e associação interfacial da membrana das hélices 1, 6, 7 e 10 em torno do hairpin transmembranar central formado pelas hélices 8 e 9.