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O principal fator de risco para infecção por Clostridium difficile (CDI) é o uso de antibióticos devido ao rompimento do equilíbrio da microbiota intestinal do hospedeiro.Para preservar as bactérias probióticas residentes benéficas durante o tratamento da infecção, o uso de moléculas com atividade antibacteriana seletiva aumenta a eficácia removendo seletivamente o C. difficile.Um deles é o alcaloide vegetal 8-hidroxiquinolina (8HQ), que demonstrou inibir seletivamente os clostrídios sem reprimir as bifidobactérias.A atividade antimicrobiana seletiva é geralmente testada por técnicas de cultura de cepas bacterianas individuais.No entanto, a principal limitação dessas técnicas é a incapacidade de descrever a dinâmica de crescimento diferencial de mais cepas bacterianas em co-cultura dentro do mesmo experimento.No presente estudo, combinamos hibridização fluorescente in situ e citometria de fluxo para descrever as alterações em células ativas e não ativas de uma cultura mista formada pelo patógeno oportunista C. dif icile CECT 531 e o benéfico Bifidobacterium longum subsp.longum CCMDMND BL1 após exposição a 8HQ.Observou-se que sem 8HQ, a proporção de ambas as cepas foi quase igual, oscilando entre 22,7 e 77,9 % durante um lapso de tempo de 12 h, enquanto que com 8HQ a proporção de C. difficile ativo diminuiu após 4 h, e persistiu apenas entre 8,8 e 17,5%.Em contraste, o crescimento bifidobacteriano não foi perturbado por 8HQ.Os resultados deste estudo mostraram o efeito inibitório seletivo do 8HQ na dinâmica de crescimento de clostrídios e bifidobactérias, e o potencial deste composto para o desenvolvimento de agentes seletivos para o controle de CDIs.